В 1386 году венецианская республика успешно договорилась о покупке Корфу, и в связи с этим Бутринти стал защитой этого государства на востоке. Господство Венеции на Средиземноморье было основано в большей степени на торговле, и поэтому республика полагалась в основном на свой сильный флот. Чтобы обеспечить морские торговые маршруты между Адриатическими и Эгейскими Морями, и опасаясь все более и более сильной и агрессивной Османской империи, венецианцы предприняли военные кампании, чтобы повторно укрепить прибрежные замки в их колониальных точках опоры в Греции. Бутринти, как самая северная из группы Ионийских прибрежных укреплений, не был исключением из этой схеме. Самым внушительным оборонительным сооружением вне старых укреплений Бутринти и самым видным венецианским творением является Венецианская Треугольная крепость на берегу Канала Вивари. Построенная после 1490 года, крепость была создана преимущественно для того, чтобы защитить рыбаков Бутринти. Созданный по уникальному проекту, лишь немногим похожим на архитектуру средневековой Европы, форма крепости, возможно, частично продиктовала формой острова, на котором она была построена.