Национальный музей-усадьба Н.И. Пирогова расположен в юго-западной части Винницы, в живописной усадьбе Вишня, где на протяжении последних двадцати лет жил и работал знаменитый ученый, гениальный хирург, анатом, творец военно-полевой хирургии, основатель Общества Красного Креста, прекрасный педагог и общественный деятель Николай Иванович Пирогов. Целью деятельности Национального музея-усадьбы Н.И. Пирогова является сохранение особенной культурной среды, которая была при жизни ученого. Это определяет смысл музея, представленного взаимосвязанной системой объектов культурного наследия и памяток садово-паркового искусства, в состав которых входят дом, в котором жил Н.И. Пирогов и где расположена экспозиция о его жизни и деятельности; музей-аптека с интерьерами приёмной и операционной Н.И. Пирогова в его усадьбе Вишня; церковь-некрополь, в которой покоится набальзамированное тело ученого; мемориальный парк, где сохранились деревья, посаженные Н.И.Пироговым.
Составной частью Национального музея-усадьбы Пирогова является и Николаевская церковь-усыпальница, которая расположена в 1,5 км от усадьбы на территории современного города Винница, в бывшем селе Шереметка.
музей-усадьба Н.И. Пирогова относится к важнейшим объектам культурного наследия Украины и занимает особенное место во внутреннем и международном туризме.