Музей основан в 1979 г. и открыт в 1982 г. Основой его стала коллекция художественного отдела Томского краеведческого музея, в которую входили небольшие разделы западноевропейского искусства XVII - XIX вв., древнерусских икон и металлопластики, живопись и графика русских художников XVIII - нач. ХХ вв. Сегодня коллекция насчитывает свыше 9000 единиц хранения. Преимущественную часть составляет современное искусство.
Музей ведет активную научно-исследовательскую, выставочную, научно-просветительскую работу. В музее действуют лекторий и видеолекторий, художественные студии для детей и взрослых, работающие по авторским программам. В музее открыта постоянная экспозиция, и 2-3 раза в месяц открываются новые выставки (продолжительность временных выставок 1-1,5 месяца). 
 56.4826, 84.9473