Пещера Заповедная является уникальной с археологической точки зрения, здесь были обнаружены следы культового сооружения палеолитических охотников. В 1969 году В.А. Марушин нашел здесь более 24 черепов пещерного медведя. Поэтому среди туристов Заповедная пещера больше известна как "Медвежья". В 1981 году археологом Ю.А. Морозовым были найдены раздробленные и обожженные кости. На основании чего он предположил, что люди использовали эту пещеру еще в эпоху палеолита. В 1990 году археолог В.К. Федоров нанес на план расположение всех сохранившихся черепов пещерного медведя и обнаружил уникальную композицию. В 1995 году под руководством палеонтолога Р. Сатаева было найдено более 300 костей большого пещерного медведя, кости сурка, лисицы, волка.
Пещера "Заповедная" находится в 8 километрах юго-восточнее деревни Верхние Лемезы. Вход в виде арки находится в основании невысокого скального выступа в верхней части правого склона долины реки Лемезы, выше водопада Атыш. Протяженность доступных ходов составляет 180 метров, амплитуда 5 метров, средняя ширина 3,8 метра, средняя высота 1,3 метра. В пещере есть несколько небольших залов, практически во всех можно ходить в полный рост, кроме одного маленького зала, где посетители устроили своеобразный "алтарь". Каждый, кто там побывал, оставляет какую-нибудь вещь. Потолок и стены пещеры покрыты кальцитовой корой, местами видны остатки многочисленных сталактитов и сталагмитов, пол покрыт натечной коркой с многочисленными гуровыми ваннами.
К сожалению, в 1990-е годы многие кости были выкопаны и вывезены из пещеры. Чтобы сохранить целостность пещеры, узкий вход в пещеру какое-то время был замурован кирпичной кладкой. В настоящее время следы культовой стоянки мирового значения и разнообразные натечные образования в основном уничтожены.