Церковь Святой Варвары была основана в 1888 году при военном госпитале. Помощь оказал император Российской империи Александр. В 1905 г. храм св. Варвары был передан патриаршеству.
В 1906 году церковь была торжественно освящена, но службы на грузинском языке долгое время не велись. Церковь передали военному ведомству батумский губернатор Дрягин, наместник Воронцов-Дашков и знаменитый священник Восторгов.
В 1996 году по личной инициативе вождя Аджарии г-на А. Абашидзе и с его помощью при сносе больницы была построена новая церковь. 7 апреля 1997 года, в праздник Благовещения, в торжественной обстановке был открыт храм святой великомученицы Варвары. Храм освятил батумский и схалтинский епископ Димитрий.