Был открыт в 2008 году по концепции, подготовленной профессором доктором Фуатом Сезгиным, историком исламской науки. В музее представлены работы, устройства и инструменты, изобретенные и разработанные исламскими учеными в период между 9 и 16 веками.
Помещения в гареме, где султаны жили со своими семьями наедине, на протяжении веков была жилищем членов Османской династии и женщин высшего сословия гарема.
Мечеть Фатих, построенная в 1463-1470 годах по приказу султана Мехмеда Завоевателя, представляла собой религиозно-общественный комплекс небывалых размеров. Она была возведена на месте полуразрушенной византийской церкви Святых Апостолов.