Пинежский краеведческий музей был создан на базе школьного музея, организованного учащимися во главе с учителем истории, участником Гражданской и Великой Отечественной войны Стирмановым Василием Ивановичем.
Верхнетоемский музей открыт 9 мая 1985 года. Музей создавался на основе Комнаты боевой и трудовой славы в здании районного Дома культуры, организаторами которой были ветераны войны и труда райцентра.