Музей основан в 1925 году. Первым директором был Н.А. Наконечный. В 1950-е музей был закрыт за отсутствием помещений. В 1960-е открыт усилиями краеведов.
Экспозиция музея отражает историю Котласского района с древнейших времен, заселение Севера, развитие судоходства на Северной Двине, строительство железной дороги "Вятка - Котлас", историю Котласа в годы революций 1905-1917 гг.