Краеведческий музей основан в 1992 году администрацией села Холмогоры и располагается в доме, построенном в 1908 году местным богачом Д.Ф. Берденниковым
Каргопольский музей основан 27 марта 1919 года, когда каргопольский мещанин Капитон Григорьевич Колпаков передал уездному отделу образования свою коллекцию предметов старины.
Датой основания Музея народных промыслов и ремёсел Приморья принято считать 1 апреля 1993 года, когда на базе общественного музея колхоза «Организатор» Лисестровского сельсовета было принято решение открыть районный музей.