Музей был открыт 29 мая 1999 года как подразделение Белгородского государственного центра народного творчества. С 2005 года музей приобрел статус государственного учреждения культуры.
В 1662 году в городе Белгороде был образован женский монастырь. В 1717 году по просьбе игуменьи Марфы к обители была приписана расположенная в семи верстах от города в урочище Лог (ныне Монастырский лес) часовня...
Белгородский художественный музей открылся 26 июля 1983 большой художественной выставкой художников-баталистов студии имени М. Грекова "На страже Родины" в старинном трехэтажном особняке, построенном в 1910 году
Краеведческий музей в Белгороде был открыт 25 октября 1924 г. как филиал Курского губернского музея. В годы ВОВ все музейные коллекции были утрачены...