Большой Гобийский Заповедник (Кластер А) расположен в юго-западной части Монголии, в провинции Говь-Алтай, в засушливом районе пустыни Гоби, на границе с Китаем. Заповедник был создан в 1976 году с целью сохранения экосистем Заалтайской Гоби.
Большой Гобийский Заповедник (Кластер Б) расположен на юго-западе Монголии, на территории аймаков Говь-Алтай и Ховд, на границе с Китаем. Заповедник был создан в 1976 году с целью сохранения экосистем Джунгарской Гоби.