Это учреждение является старейшим музеем в стране и было основано в 1844 году. Проект был инициирован сербским писателем Йованом Стерией Поповичем, а с 1952 года музей находится на нынешнем месте в здании, построенном в 1903 году.
Мемориальный музей Йована Цвиича создан в доме, в котором жил и работал этот великий географ и ученый. Это здание с окружающими его садами было построено в 1905 году по его собственным эскизам и пожеланиям и отражает дух начала 20 века.