Первое упоминание об усадьбе относится к 1422 году. Одним из последних помещиков был Александр Константин фон Барлевен. Нынешнее здание восстановлено из развалин.
Мыза Вяэна вместе с приусадебным парком и близлежащими постройками обладает особой ценностью благодаря своей интересной культурной истории и художественной ценности.