Церковь была построена в 1873 году на месте прежней, деревянной. За основу строительства был взят типовой проект архитектора Г.Шнелля, по которому также построена Апостольская православная церковь Святой Троицы в Поотси-Кыпу.
Расположенная в самом центре города Яановская церковь была построена в 1816 г. по проекту архитектора К. Хаберланда, и является единственной в Эстонии церковью овального плана.